В Ферганской долине началась война. Мирза Умаршейх, правитель Ферганы, столкнулся с предательством со стороны своего брата, Султана Ахмада, и зятя, Махмуда-хана.
Оба они, движимые жаждой власти, решили захватить земли Ферганы.
В это время в Куве, небольшом городке на границе Ферганской долины, молодой гончар Тахир и его возлюбленная Робия столкнулись с ужасами войны.
Сундук с приданым Робии спрятали в амбаре, а саму девушку отправили в Андижанскую крепость, надеясь на безопасность за ее стенами. Тахир, движимый любовью к Робии и желанием защитить ее, решил поджечь деревянный мост через реку Кувасай, чтобы задержать наступление вражеского войска. Вместе с друзьями он ночью пробрался к мосту и начал рубить опоры. Затея не удалась – мост оказался слишком прочным, но ослабленные опоры не выдержали нагрузки, когда утром на мост вступило войско Султана Ахмада. Мост обрушился, множество воинов погибло в бурном потоке, наступление захлебнулось.
В Андижанской крепости двенадцатилетний Бабур, наследник престола Ферганы, узнал о смерти отца, мирзы Умаршейха.
Во время внезапного обвала берега голубятня, на которой находился мирза, рухнула в реку. Бабур, потрясенный горем, отправился в крепость, но был встречен своим дядей, Шеримбеком, который уговорил его уехать из опасного Андижана. Бабур, не желая оставаться в крепости, где царили страх и растерянность, согласился уехать в Ош, город на юге Ферганской долины.
Между тем в Андижане началась борьба за власть. Ахмад Танбал, тайно поддерживаемый Фатимой-султан, первой женой мирзы Умаршейха, решил сделать новым правителем Ферганы младшего сына мирзы, Джахангира.
Танбал распустил слухи о том, что Бабур сбежал, боясь врагов. Напуганные беки, не желая противостоять Шейбани-хану, приближавшемуся к Андижану, решили поддержать Джахангира.
Бабур, узнав об измене беков, вернулся в Андижан и, заручившись поддержкой своего учителя Ходжи Абдуллы, вступил на престол. Новое правление началось с казни дервиша Гова, обвиненного в распространении ложных слухов. Гов был невиновен, но Бабур, поддавшись давлению беков, не решился его защитить.
В Куве, куда вернулся после налета разбойников зодчий мулла Фазлиддин, воины Султана Ахмада, отступая после неудачной переправы через Кувасай, учинили грабеж.
Робия, вышедшая из своего укрытия, была схвачена и уведена в Самарканд. Тахир, пытаясь защитить девушку, убил одного из воинов, но сам был тяжело ранен. Робию увезли.
Бабур, став правителем, начал строительство в Оше небольшой хужры, поручив это дело мулле Фазлиддину. Ханзода-бегим, старшая сестра Бабура, помогала зодчему, и между ними возникла взаимная привязанность.
Бабур, увлеченный мечтой о Самарканде, решил пойти в поход, хотя его мать и сестра отговаривали его от этого. Во время похода Бабур увидел, как его военачальник Ахмад Танбал расправился с непокорными чаграками, и был потрясен жестокостью этой расправы.
В Самарканде Бабур, наконец, осуществил свою мечту, взяв город после семимесячной осады. Бабур женился на Айше-бегим, дочери Султана Ахмада, но молодая жена не смогла увлечь его, и их отношения оставались холодными.
В Андижане же заговорщики, не теряя даром времени, начали плести новые интриги. Ахмад Танбал, уязвленный отказом Ханзоды-бегим выйти за него замуж, объединился с другими недовольными беками и поднял мятеж, провозгласив Джахангира правителем. Бабур, узнав об измене, спешно отправился из Самарканда в Андижан, но по дороге тяжело заболел и потерял дар речи.
Ханзода-бегим, узнав о болезни брата, решила спасти его ценой собственной свободы. Она вышла замуж за Шейбани-хана, грозного правителя, который уже завоевал большую часть Мавераннахра, и тем самым добилась перемирия.
Бабур, покинув Самарканд, уехал в Ташкент к своему дяде Махмуд-хану, но тот, боясь Шейбани-хана, не оказал племяннику должной поддержки. Бабур, разочарованный, развелся с Айшей-бегим и уехал в Ура-Тюбе, горный край на юге Мавераннахра.
Мулла Фазлиддин, спасенный Тахиром из тюрьмы, отправился в Герат, надеясь на покровительство Алишера Навои. Тахир, вновь отправившись на поиски Робии, наконец нашел ее в Самарканде, в гареме одного из купцов. Они поженились.
Бабур, найдя в себе силы оправиться от поражений, снова взял Самарканд, но его беки, недовольные тем, что Бабур не разрешал грабить город, начали покидать его. Шейбани-хан, воспользовавшись случаем, снова напал на Самарканд и, использовав военную хитрость, разгромил войско Бабура. Бабур, потеряв Самарканд, бежал в Ташкент, где узнал о гибели своего дяди Махмуд-хана. Шейбани-хан, захватив Ташкент, разделил жен и дочерей плененного хана между своими приближенными. Айша-бегим стала женой старого Кучкинчи-хана.
Бабур, отчаявшись, уехал с остатками войска в Кундуз. Там он встретился с сестрой, Ханзодой-бегим, которую освободил из плена шах Исмаил, правитель Ирана, победивший Шейбани-хана. Бабур, заключив союз с Исмаилом, снова начал войну против шейбанидов. Бабуру удалось взять Бухару и Самарканд, но вскоре он потерпел поражение от Убайдуллы Султана, племянника Шейбани-хана, и был вынужден снова покинуть Самарканд.
Бабур, устав от бесконечных войн и разочарованный в своих соотечественниках, решил искать счастья в Индии. Он перешел с войском реку Синд и вторгся в пределы Делийского султаната. В битве при Панипате Бабур, благодаря военному таланту и использованию пушек, разгромил стотысячное войско султана Ибрагима Лоди. Ибрагим погиб, Бабур занял Дели, а затем и Агру, столицу султаната.
В Индии Бабур столкнулся с новыми проблемами. Его воины, привыкшие к грабежам, начали разорять города и села. Венценосная Байда, мать Ибрагима, попыталась отравить Бабура. Бабур, оправившись от яда, простил Байду, но лишил ее всех богатств. Бабур, утомленный бесконечными войнами и интригами, решил передать трон своему сыну Хумаюну.
Хумаюн, став шахом, продолжал дело отца — строительство новых дворцов и садов, привлечение талантливых людей из разных стран. Но и его жизнь, как жизнь Бабура, была полна драматических событий, борьбой, поражениями, потерями. Бабуру, умершему в Агре, не удалось вернуться на родину. Его тело похоронили в Кабуле. Ханзода-бегим, пережив брата, умерла в Кабуле, ее похоронили рядом с Бабуром.
Книга «Бабурнаме», написанная Бабуром на тюркском языке, стала не только памятником его жизни, но и ценнейшим историческим источником, дошедшим до наших дней. Она была переведена на многие языки мира и до сих пор привлекает читателей своей искренностью, живым языком и правдивым описанием событий той далекой эпохи.