Юный волшебник Гарри Поттер, обучающийся в Школе чародейства и волшебства "Хогвартс", окончив первый курс, проводит свои летние каникулы в доме своих опекунов Дурслей – дяди Вернона и тёти Петуньи. Во время отдыха ему запрещено колдовать, но семейство Дурслей, ненавидящее всё волшебное, об этом не знает и боится мальчика. Семейство Дурслей поглощено предстоящей крупной сделкой, предстоящей дяде Вернону сегодня во время ужина, на который он пригласил своего клиента вместе с супругой. Во время этого мероприятия мальчику полагается сидеть тихо у себя в комнате и не выходить. К Гарри в комнату является домовой эльф Добби, он хочет уберечь мальчика от некой опасности – от заговора, который назревает в школе. Для того, чтобы осуществить свой план домовик совершает волшебство в доме, где живёт Гарри. Практически сразу из Министерства Магии приходит письмо с предупреждением, что в случае повторного нарушения закона ему грозит исключение из школы. Заставив Гарри прочитать письмо, мистер Дурсль решил замуровать его в комнате, поставив на окна решётки и таким образом надеясь выбить из головы мальчика всё волшебство. Выручать Гарри прибывают на летающем автомобилей своего отца – старом фордике «Англия», трое из братьев Уизли: близнецы Фред и Джорд и его школьный друг, однокурсник Рон. Они привозят Гарри к себе домой. Перед началом учебного года все отправляются в Косой переулок. Гарри впервые пользуется новым для себя способом перемещения – Летучим порохом, и попадает в антикварный черномагический магазин в Лютном переулке. В этот момент в магазин в сопровождении своего отца Люциуса заходит школьный неприятель Поттера – Драко Малфой. Гарри прячется в чёрный шкаф, и сидит там пока неприятели не покидают лавку. Мальчик спешит на улицу, где его находит Хагрид и показывает дорогу к Косому переулку. Здесь он находит семейство Уизли и встречается с подругой Гермионой. Отправившись в книжный магазин приобрести учебники, они встречаются с популярным в волшебном мире писателем, описывающим собственные подвиги – Златопустом Локонсом. Он дарит Гарри все свои книги и сообщает, что в новом учебном году он будет преподавать в Хогвартсе защиту от Тёмных искусств. Артур Уизли и Люциус Малфой устраивают потасовку в магазине, но их разнимает Хагрид. Каникулы заканчиваются, Гарри и его друзьям пора отправляться в «Хогвартс», прибыв на вокзал Кингс-Кросс, все попадают на поезд «Хогвартс-Экспресс», кроме Гарри и Рона, которых магический барьер не пропускает на платформу 9 3/4 . Тогда мальчики отправляются в школу на летающем автомобиле мистера Уизли. К концу пути заколдованный автомобиль начинает постепенно уставать, глохнуть и врезается в Гремучую иву – дерево, обладающее скверным и драчливым характером. При аварии у Рона ломается волшебная палочка. Получив изрядное количество ударов ветвями фордик сам по себе заводится и отъезжает на безопасное расстояние, после чего вышвыривает незадачливых путешественников вместе с вещами из салона, а затем скрывается в чаще Запретного леса. Друзья направляются в школу, но им на пути попадается нелюбимый преподаватель профессор Северус Снегг. Он отводит мальчиков к себе в кабинет, где рассказывает, что они нарушили закон и теперь должны быть наказаны. Для этой цели также приглашена декан факультета Гриффиндор Минерва МакГонагалл. Ученикам объявляют последнее предупреждение, следующее нарушение уже грозит отчислением. В первый выходной рано утром второкурсника будит капитан сборной Гриффиндора по квиддичу, он планирует начать тренироваться раньше других команд и выиграть школьный кубок. Однако к полноценной тренировке приступить не удаётся, на поле появляется сборная Слизерина, для того чтобы опробовать нового ловца – Драко Малфоя, отец которого сделал всей команде щедрый подарок – новейшие метлы модели «Нимбус-2001». Происходит словесная перепалка, в течении которой Драко обзывает Гермиону «грязнокровкой» - гнуснейшим ругательством в волшебном мире. Рональд пытается наслать на слизеринца проклятие, но сломанная палочка отправляет заклятие в своего владельца, и мальчик начинает отрыгивать слизней. Во время отбывания наказания Гарри, помогающий отвечать Локонсу на письма поклонников, внезапно слышит странный страшный голос:
«Иди… иди ко мне… дай мне схватить тебя… разорвать… убить…» Шаблон:/цитата
Однако профессор Локонс ничего не слышит, он думает, что Гарри задремал и отпускает его.
Накануне Хэллоуина, возвращаясь с тренировки, Гарри встречается с привидением башни Гриффиндор Почти Безголовым Ником, который приглашает Гарри вместе с друзьями посетить его Юбилей смерти. Тридцать первого октября друзья, помня о данном обещании, отправляются в Подземный зал, где Гермиона знакомит Гарри и Рона с очень обидчивым привидением из женского туалета – Плаксой Миртл. Покинув праздник, друзья отправляются в Большой зал, но по дороге Гарри опять слышит тот самый пугающий голос. Троица, преследуя голос, слышимый только Гарри, прибегает на третий этаж, где находят окоченевшую миссис Норрис – кошку школьного завхоза Аргуса Филча, а рядом на стене надпись
«ТАЙНАЯ КОМНАТА СНОВА ОТКРЫТА. ТРЕПЕЩИТЕ, ВРАГИ НАСЛЕДНИКА!».
Друзей замечают на месте преступления, но Дамблдор опровергает версию завхоза о том, что Гарри причастен к этому нападению – ведь, ученику второго курса такое не под силу. Кошку выведут из оцепенения, когда поспеют мандрагоры в школьных теплицах, из которых можно приготовит целительное снадобье.
На уроке истории магии преподаватель рассказывает легенду о Тайной комнате и неком чудовище, заточённом в ней. Легенда гласит, что открыть Тайную комнату и освободить монстра может только истинный наследник Слизерина.
Друзья предполагают, что, возможно, наследником Слизерина является злейший враг Гарри – Драко Малфой. Для того, чтобы точно это выяснить Гермиона предлагает проникнуть в Общую гостиную Слизерина и выяснить это у самого Малфоя. С этой целью девочка собирается готовить Оборотное зелье, которое позволяет принимать облик другого человека.
В субботнее утро проходит первый матч по квиддичу между сборными Гриффиндора и Слизерина. На матче Гарри начинает преследовать бладжер, пытаясь сбить игрока с метлы. По правилам бладжеры не гоняются за одним игроком, а выбивают как можно больше игроков. Заколдованный мяч ломает Гарри руку, но несмотря на это он ловит маленький золотой снитч, чем приносит победу своей команде. Приземлившись, Гарри теряет сознание, а придя в себя он видит профессора Локонса. Несмотря на протесты пострадавшего профессор решает помочь Гарри и применяет заклинание, но вместо того, чтобы излечить перелом, он просто убирает из руки все кости, что вызывает ярость школьной медсестры. Теперь Гарри предстоит провести ночь в больничном крыле выращивая новые кости.
Ночью мальчика посещает Добби. Выясняется, что это он заколдовал магический барьер на вокзале, в надежде, что Гарри Поттер передумает ехать в школу и вернётся домой, заговорённый мяч сломавший Гарри руку – тоже его рук дело. Добби думал, что если мальчик покалечиться, то вернётся домой:
«…Лучше уж жить дома калекой, чем оставаться тут…» Шаблон:/цитата
В разговоре с домовиком Гарри узнаёт, что такое поведение домового эльфа связанно с открытием Тайной комнаты. Добби и Гарри прерывают разговор, так как в лазарете появляются преподаватели Гарри, прикинувшись спящим, слышит о новом нападении, на этот раз его жертвой стал первокурсник с факультета Гриффиндор – Колин Криви, который в свободное время неустанно фотографирует своего кумира – Гарри Поттера. За ночь у мальчика вырастаю новые кости, и Гарри выписывают из больничного крыла.
Перед рождественскими каникулами в школе открывается дуэльный клуб, вести который вызвался профессор Локонс, а ассистентом выступает профессор Снегг. Они устраивают показательный поединок, практически сразу и закончившийся. На показательной дуэли Снегг разоружает Локонса заклинанием «Экспелиармус». Далее Златопуст Локонс решает перейти к практической части – учеников делят на пары. Но первая попытка проведения дуэлей оказывается неудачной, тогда Локонс предлагает начать с двумя добровольцами. Снегг предлагает Поттера и Малфоя. Профессор зельеварения что-то шепчет на ухо Драко. По началу из его палочки вылетает длинная чёрная змея. Локонс пытается убрать её, но она лишь переключается на студента с факультета Пуффендуй – Джастина Финч-Флетчли. Гарри отдаёт змее приказ: «Убирайся». Змея успокаивается, но вместо благодарности от Джастина мальчик получает взгляд полный ужаса и неприязни. От своих друзей Гарри узнаёт, что в волшебном мире способность говорить со змеями – признак чёрного мага.
Утром, переживая, что не поговорил и не объяснился с Джастином, Гарри отправляется на его поиски. Случайно Гарри подслушивает разговор пуффендуйцев – они считают, что Гарри Поттер и есть наследник Слизерина.
Гарри обнаруживает обездвиженных Джастина Финч-Флетчли и Почти Безголового Ника. Мальчик хочет убежать, но появившийся полтергейст Пивз начинает голосить и на шум сбегаются люди. Отправив пострадавших в больничное крыло профессор МакГонагалл ведёт Гарри в кабинет Дамблдора.
В рождественское утро оборотное зелье готово. Добавив последние ингредиенты, друзья принимают зелье, после чего переодеваются в заранее подготовленную одежду. Гермиона по непонятной причине отказывается выходить из своей кабинки, и в гостиную Слизерина Гарри с Роном отправляются вдвоём. Они говорят с Малфоем, но он тоже не знает кто является наследником Слизерина. Вернувшись в туалет Плаксы Миртл рассказать Гермионе о том, что они выяснили – но девочке не до этого. По досадной ошибке Гермиона кинула в зелье не человечески волос, а кошачий, а оборотное зелье не превращает людей, оборотившихся в животных обратно.
Гермиона проводит в больничном крыле несколько недель. Возвращаясь от неё Гарри и Рон, слыша ругательства Филча по поводу разлитой воды, заглядывают в туалет Плаксы Миртл, откуда она и течёт. Там мальчики находят дневник Тома Реддла, где владелец ничего и никогда не писал. Чуть позднее мальчик обнаруживает странное свойство дневника – чернила исчезают с его страниц. Вечером Гарри начинает писать в дневнике и таким образом выходит на связь с предыдущим владельцем. Том Реддл показывает Гарри своё воспоминание об ускользнувшем чудовище и о том, как он разоблачает наследника Слизерина – им оказывается Хагрид, впоследствии исключенный за эту историю. Как-то вечером кто-то проникает в комнату второго курса, устраивает там беспорядок, очевидно, обыскивая вещи Гарри, среди которых пропал только дневник Тома Реддла.
Перед матчем по квиддичу Гарри снова слышит непонятный голос, Гермиона, озарённая догадкой убегает в библиотеку. Перед самым началом матча появляется профессор МакГонагалл и сообщает о его отмене. Забрав с собой Гарри и Рона она отводит их в больничное крыло, где лежат жертвы нового нападения – Гермиона Грейнджер и девушка из Когтеврана. Их нашли у библиотеки, а рядом с ними маленькое зеркальце – ни Гарри, ни Рон даже не предполагают, что это может означать.
В школе вводятся повышенные меры безопасности, и Гарри приходит к выводу, что пришло время воспользоваться мантией-невидимкой, наведаться к Хагриду и выведать информацию о Тайной комнате. Поздно вечером, когда другие ученики спят, Гарри и Рон идут к Хагриду. Их впускает нервничающий великан, но поговорить им не удаётся. Через несколько минут после прихода в дверь раздаётся стук, мальчики прячутся под мантию, а Хагрид впускает гостей – директора школы Альбуса Дщамблдора и министра магии Корнелиуса Фаджа, через некоторое время появляется Люциус Малфой – он требует отставки Дамлдора. Хагрида арестовывают и забирают в Азкабан, перед тем как уйти Хагрид говорит фразу, обращённую вроде бы в никуда, но на самом деле она предназначается для невидимых Гарри и Рона – он даёт совет следовать за пауками.
Проследив за убегающими пауками друзья совершают вылазку в Запретный лес. На них нападает гигантский паук и несёт их в паучье логово к своему родителю и вожаку – Арагогу. В разговоре с ним выясняется, что это не он монстр из Тайной комнаты. Хагрид был обвинён и арестован зря, а чудище из Тайной комнаты является злейшим врагом пауков, они боятся его до такой степени, что никогда не произносят его имени. Пауки не хотят отпускать мальчиков намереваясь полакомиться ими, но их спасает внезапно появившийся одичавший фордик.
Поздно вечером обдумывая слова Арагога, об убийстве девушки полувековой давности Гарри в голову приходит мысль – а что, если эта девушка, точнее её привидение, по-прежнему живёт там, где её убили, то есть в женском туалете. Тогда это…. Плакса Миртл. Но поговорить с ней об этом не так-то просто – преподаватели после нападений постоянно прочёсывают школу и ни на минуту не оставляют студентов без присмотра.
За три дня до экзаменов спеют мандрагоры и теперь уже к вечеру возможно вернуть всех пострадавших к нормальной жизни. Гарри и Рон отправляются к Плаксе Миртл, убедив Локонса не сопровождать гриффиндорцев до другого кабинета, но их замечает профессор МакГонаггал, ребята делают вид, что направляются в больничное крыло – навестить Гермиону и растроганная профессор позволяет им это сделать.
Сидя возле Гермионы Гарри замечает небольшой клочок бумаге, сжатый в правой руке девочки. Эта страница, вырванная из книги – мальчики узнают, что это чудовище – василиск, а приметка Гермионы «трубы» проливает свет на то, как оно передвигается по замку. Всё становиться на свои места, а Гарри и Рон начинают догадываться, что скорее всего вход в Тайную комнату находится в туалете Плаксы Миртл.
Друзья, решившие сообщить всё профессору МакГоннагал, бегут в учительскую. Внезапно они слышат сообщение, которое она передаёт:
«Всем ученикам немедленно вернуться в свои спальни. Всем преподавателям собраться в учительской. Пожалуйста, как можно скорее» Шаблон:/цитата
Спрятавшиеся мальчишки слушают разговор преподавателей. Совершенно ещё одно нападение – монстр напал на Джинни Уизли, и, на этот раз, утащил ребёнка в Тайную комнату. Готовятся закрывать школу, а учеников отправлять по домам.
Собрание прерывает появившийся Локонс, уже порядком надоевший своим хвастовством всем преподавателям. Ему дают поручение – отправиться в Тайную комнату и сразиться с монстром. Преподаватели и не надеются, что он справиться – лишь бы не мешался под ногами. Вечером Гарри и Рон приходят к Локонсу в кабинет, в надежде, что собранная ими информация, поможет Златопусту победить василиска. Но они застают Локонса, готовящимся к бегству. Выясняется, что профессор никогда не совершал описанных им подвигов, а просто присваивал себе их подвиги, а при помощи заклинания забвения заставлял их забыть их.
Он пытается наслать заклятие на Гарри и Рона, но Гарри обезоруживает профессора и заставляет его идти вместе с ними в туалет Плаксы Миртл, где у раковины ребята находят трубу ведущую в Тайную комнату. Первым в комнату по трубе заставляют спуститься Локонса, затем Гарри и Рон. Они долго катятся по трубе, и наконец оказываются глубоко под школой, где обнаруживают сброшенную василиском кожу. Локонс нападает на Рона и забирает у него палочку, пытается произнести заклинание, но сломанная палочка рикошетом направляет его в него самого. Начинается камнепад, и теперь груда камней разделяет Гарри с одной стороны, а Рона и Локонса с другой. Гарри отправляется искать Джинни, а Рон начинает разбирать завалы.
Гарри находит Джинни без чувств, тут же он видит Тома Реддла, точнее его фантом, появившийся из дневника. Он говорит, что её жизнь подошла к концу. Открывается страшная правда: Том посредством дневника оказывает воздействие на Джинни, и именно зомбированная девочка отрыла вход в Тайную комнату, учинила расправу над школьными петухами и устроила обыск в вещах Гарри.
Палочка Гарри у него в руках, а Том Реддл оказывается не кем иным как лордом Волан-де-Мортом, тем самым Тёмным волшебником, что убил родителей Гарри.
На подмогу Гарри прилетает феникс Дамблдора, и приносит волшебную шляпу. Том призывает василиска, чтобы покончить с Гарри, но Феникс лишает змея смертоносного взгляда, выклевав ему глаза. Гарри просит помощи у волшебной шляпы и получает её вытащив из неё меч.
Гарри убивает василиска, вонзив меч ему в нёбо, но и сам мальчик ранен – царапина, которую оставил ему василиск на плече наполнилась ядом змея. От неминуемой смерти Гарри спасает феникс – он проливает слёзы на рану Гарри, которые обладают целительной силой.
Гарри выдёргивает клык из раны и вонзает его в дневник – воспоминание Тома Реддла исчезает, а Джинни приходит в себя. Гарри и Джини возвращаются к Рону; выясняется что Локонс полностью потерял память.
Феникс, благодаря своей способности переносить огромные грузы, поднимает всех четверых наверх и привод к кабинету профессора МакГоннагал, где кроме неё самой находятся Дамблдор, а также мистер и миссис Уизли – Гарри рассказывает обо всех пережитых приключениях. Джинни отправляют в больничное крыло. Гарри и Рон получают награды за особые заслуги перед школой, и по двести призовых очков. Рон по поручению Дамблдора отводит Локонса в лазарет.
Обеспокоенный Гарри выясняет, что он истинный гриффиндорец, так как меч, который он достал из шляпы, принадлежал Годрику Гриффиндору.
Появляется взбешённый Люциус Малфой вместе с Добби, он недоволен тем, что Дамблдор вернулся в школу, но выясняется, что попечительский совет узнав, что совершенно ещё одно нападение, поспешили попросить Дамблдора вернуться.
Благодаря жестам Добби Гарри догадывается, что именно Люциус Малфой подсунул дневник Джинни Уизли во время посещения книжного магазина. Люциус удаляется.
Гарри освобождает Добби и напоследок Гарри берёт с домовика обещание больше не спасать ему жизнь.
Празднование длилось всю ночь – монстра больше не будет, экзамены отменены, Локонс больше не будет преподавать, Гриффиндор побеждает, завоевав Кубок школы.