Повесть «Антихрист» отсылает нас к средневековой Болгарии. Это времена завоеваний османской империи, и Болгария оказывается все более и более завоёванной агарянами. Вся повесть представляет собой описание жития Теофила, монаха, сына Тодора Самохода, царского богомаза, как написано в начале произведения. В первых главах мы узнаём о его детстве. В то время он имел мирское имя Эню. Но Эню был необычным ребенком, наделенный красотой и даром писать поэзию, в которой восхвалял Бога. С детства его начали терзать сомнения и беспокойство, всё более его занимали вопросы мироздания и место человека в мире между Сатаной и Богом.
Отец его создавал иконы при царе Иване-Александре в городе Тырновград, и однажды юный Эню познакомился с дочкой царя Денницей. Именно эта встреча и послужила развитию всё больших сомнений в церкви и попах, а также написанию стихов, посвящённых этой девочке. Про его дар стало известно царю, за что тот наградил его золотым пером. Но в недалеком времени девочку отослали и выдали замуж. При разговоре с Эню отец заметил его вольнодумие и очарование красотой материалистического мира, что было недопустимо для верующего человека, так как мир материалистический был в оппозиции к миру божественному. О своих сомнениях Эню исповедался отцу Лаврентию, после чего решил с его помощью уйти в монастырь, дабы укрепиться в вере, чтобы его не одолел дьявол. По дороге они стали свидетелями Фаворского огня, божественной благодати, которая спустилась на святого в его келье во время молитвы.
Когда они прибыли в монастырь, Эню взяли послушником, а отец Евтимий наблюдал за ним, так как тоже видел в нём сомнения и склонность ко злу. Именно поэтому он назначил его прислужником к отцу Луке, бывшему разбойнику, который часто попирал монастырский устав и сквернословил. Всё это было сделано, дабы испытать веру Эню. Он стал ловить рыбу для отца Луки, и однажды против своей воли пошёл с ним на рынок, что было делать нельзя. Именно на рынке он увидел роковую женщину, которая изменила его жизнь. Это была блудница, как он считал, и она как будто искала его. По приходу обратно отец Лука вместе с Эню были наказаны.
Вскоре после смерти отца Луки Эню принял монашество. Проходили годы, и главный герой мужал, укреплялся в вере и становился красивым молодым человеком. Однажды осенил его свет Фаворский и не увидел он в этом свете благодати, а пошатнулась его вера и ночью приснился ему сон о втором распятии Иисуса, а он был тот самый Иуда Искариот. И однажды на берегу реки, когда он ловил рыбу, встретилась ему та самая девушка с базара. Девушку звали Арма, и она принадлежала к секте, которая чтила и Бога и его брата Сатану. Сатану задабривали оргиями, которые устраивали в лесу, а Бога - слезливыми молитвами. Сперва Эню поражал сектантов своей чистотой, но затем он начал впадать в грех и безразличие, и стал жестоким, что вылилось в убийство бывшего любовника Армы, грека Панайотиса. Отобрав его деньги и спрятав тело, они покинули секту, так как Арма была беременна.
У Армы произошёл выкидыш. К этому времени на деньги Панайотиса была куплена лодка, и Эню с Армой стали за плату переправлять людей через реку и продавать рыбу монастырю, которому принадлежали угодья. Жизнь налаживалась, но время от времени к ним стал заходить монах и задавать «лишние» вопросы: почему они не ходят в церковь, кто их венчал и т. д. Это было опасно - монах мог узнать, кто они и заподозрить их в ереси. Однажды Эню выловил крупную рыбу. Он не мог вытащить её из реки и пошёл домой за нужным инструментом. В доме он застал отца Доросия в постели с Армой и убил его. Тело Эню выкинул, но всё же его заподозрили в преступлении и начали судить и за убийство, и за ересь. В это время в столице проходил суд над еретиками и евреями. В тюрьме Эню помог одному турку, которого выпустили при обмене пленных. Эню навестил отец Евтимий с которым он беседовал о вере. Монах не мог понять, как тот сохранил её.
В наказание за ересь Эню поставили клеймо на лице. Он начал бродить по стране, убивая агарян, которые завоевывали Болгарию, но однажды его схватили. Предводителем того отряда агарян был тот самый турок, которому помог Эню. в благодарность турок сохранил ему жизнь и сделал своим слугой. Позже Шеремет-бей, бывший выше турка по чину, забрал Эню к себе. Начался военный поход. Тырновград начали штурмовать, но Евтимий стоял непоколебимо. Став предводителем войска, он многими людьми пожертвовал ради сохранения веры. Город был взят. Сестра и мать Эню были убиты, отец умер раньше. Евтимия взяли в плен, Эню же наконец нашёл себя, возлюбил болгарский народ и человека, свободного от предрассудков земных и небесных законов, утесняющих человека. Но это не помешало ему убить предателя, родственника царя и Шеремет-бея. Находясь в бегах, он написал своих воспоминания.
Пересказал Похвала Богдан